Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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FOXQ1Q9C009 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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FOXQ1Q9C009 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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FOXQ1Q9C009 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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FOXQ1Q9C009 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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FOXQ1Q9C009 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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