Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HINFPQ9BQA5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms