Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms