Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms