Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP9Q99956 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms