Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms