Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF4Q99607 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms