Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms