Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD27Q96NW4 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms