Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NSMCE2Q96MF7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms