Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms