Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms