Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms