Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HDAC11Q96DB2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDAC11Q96DB2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDAC11Q96DB2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDAC11Q96DB2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDAC11Q96DB2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDAC11Q96DB2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDAC11Q96DB2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDAC11Q96DB2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDAC11Q96DB2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDAC11Q96DB2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms