Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HGDQ93099 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HGDQ93099 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HGDQ93099 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HGDQ93099 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HGDQ93099 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HGDQ93099 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HGDQ93099 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HGDQ93099 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HGDQ93099 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HGDQ93099 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HGDQ93099 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HGDQ93099 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HGDQ93099 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HGDQ93099 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HGDQ93099 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HGDQ93099 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HGDQ93099 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HGDQ93099 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HGDQ93099 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HGDQ93099 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HGDQ93099 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HGDQ93099 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HGDQ93099 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HGDQ93099 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms