Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPDL3AQ92484 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms