Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU4

FDCSP, Follicular dendritic cell secreted peptide, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDCSPQ8NFU4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDCSPQ8NFU4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDCSPQ8NFU4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FDCSPQ8NFU4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FDCSPQ8NFU4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FDCSPQ8NFU4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FDCSPQ8NFU4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FDCSPQ8NFU4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FDCSPQ8NFU4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FDCSPQ8NFU4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FDCSPQ8NFU4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FDCSPQ8NFU4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FDCSPQ8NFU4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms