Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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