Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms