Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms