Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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CLDN19Q8N6F1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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