Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LNX2Q8N448 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms