Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms