Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC141Q6ZP82 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC141Q6ZP82 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms