Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFWD3Q6PCD5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms