Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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CNNM4Q6P4Q7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNNM4Q6P4Q7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNNM4Q6P4Q7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
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