Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRC8EQ6NSJ5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRC8EQ6NSJ5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRC8EQ6NSJ5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRC8EQ6NSJ5 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRC8EQ6NSJ5 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRC8EQ6NSJ5 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRC8EQ6NSJ5 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRC8EQ6NSJ5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms