Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms