Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms