Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF17Q5VTA0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms