Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms