Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF628Q5EBL2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms