Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4L6Q3SYB3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms