Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EDRF1Q3B7T1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EDRF1Q3B7T1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EDRF1Q3B7T1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EDRF1Q3B7T1 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EDRF1Q3B7T1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms