Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms