Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC27Q2M243 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms