Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms