Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
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