Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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