Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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PTPRNQ16849 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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PTPRNQ16849 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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PTPRNQ16849 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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PTPRNQ16849 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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PTPRNQ16849 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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PTPRNQ16849 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRNQ16849 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
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