Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms