Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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