Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CARTPTQ16568 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms