Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDB1Q16531 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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