Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCOA1Q15788 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
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