Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIX1Q15475 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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