Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCM1Q15154 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms