Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
EEA1Q15075 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EEA1Q15075 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms