Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
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