Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2Q13563 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
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